《表2 毛果杨SHMT基因家族》

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《杨树SHMT基因家族分析及PtrSHMT9突变体创制》


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从毛果杨基因组上我们识别出9个Ptr SHMT基因(见表2),命名为Ptr SHMT1~Ptr SHMT9。9个成员均具有丝氨酸羟甲基转移酶功能结构域,且磷酸吡哆醛结合位点位于该功能结构域内。对毛果杨、拟南芥和水稻SHMT家族所有成员构建进化树,结果显示21个SHMT聚成2个亚类(见图1A),Ptr SHMT1/2/3/5/9、At SHM4/5/6/7和Os SHMT2/3/4/5聚为一类,则Ptr SHMT4/6/7/8、At SHM1/2/3和Os SHMT1聚成另一类。基因结构分析显示(图1B),进化树聚类一族的Ptr SHMT1/2/3/5/9具有3个内含子和4个外显子,另一族Ptr SHMT4/6/7/8分别有12~15个外显子。