《表3 毛果杨Pt HIPPs蛋白的基序序列》
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《杨树重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPPs)基因的鉴定及表达分析》
PtHIPPs基因的外显子/内含子结构分析结果显示(图4B),5个PtHIPPs基因具有相同的外显子/内含子结构,均含有3个内含子,但是内含子和外显子的长度存在差异。利用MEME软件在Pt HIPPs蛋白序列中共预测了十个保守基序(命名为motif 1~10)(表3,图4C)。Pt HIPPs蛋白都包含基序1、2、3、4和基序5,且这5个基序在每个Pt HIPPs蛋白中的排列顺序相同;基序1和基序3中分别包含一个重金属结合基序MXCXXC。同一亚组中的Pt HIPPs蛋白通常含有相似的基序组成,且基序的排列顺序也相同;不同亚组的Pt HIPPs蛋白之间基序组成存在差异。基序6仅存在于SI亚组成员中;SII亚组蛋白含有8~9个基序,且基序7和基序10仅存在于SII亚组蛋白中。SIII与SII成员中基序9的位置存在明显差异。预测的这些基序在Pt HIPPs蛋白中的相关功能还有待实验验证。
图表编号 | XD00109128000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.01 |
作者 | 王琪、许志茹、陈瑾元、张双、黄佳欢、刘关君 |
绘制单位 | 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学生命科学学院、东北林业大学生命科学学院、东北林业大学生命科学学院、东北林业大学生命科学学院、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 |
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