《表2 SiASRs蛋白的基序》
由结合Si ASRs基因的编码区(CDS)序列和基因序列绘制的谷子ASR家族基因结构图(图3)可以看出,只有Si ASR3、Si ASR4没有内含子,SiASR1、SiASR2、SiASR5、SiASR6、SiASR7和Si ASR8都有1个内含子。Si ASR1和Si ASR5、Si ASR7和Si ASR8在结构上非常相似,都为串联重复基因,彼此在进化上聚为一类。通过MEME网站鉴定了Si ASRs蛋白的保守基序,共发现了18个基序元件。这些保守基序的长度短的有6个氨基酸,长的最多达到50个氨基酸。表2中列出了18个基序的详细信息。通过对Pfam、CDD的分析,motif1、motif2、motif3完全对应Si ASRs蛋白的保守域(ABA/WDS)。Si ASR1和Si ASR5蛋白所含的基序都相同,都含有4个基序;Si ASR3有6个基序响应元件;SiASR4有5个基序;SiASR7有7个基序响应元件,SiASR8比Si ASR7多1个motif16元件,其余的响应元件均相同;SiASR2有11个基序响应元件;SiASR6蛋白拥有的基序数量最多。SiASR1、Si ASR2、Si ASR5、Si ASR6、Si ASR7和Si ASR8蛋白都含有motif4。这与系统发育树的分类结果一致。
图表编号 | XD00128660700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.15 |
作者 | 宋健、曹晓宁、王海岗、陈凌、王君杰、刘思辰、乔治军 |
绘制单位 | 山西大学生物工程学院、山西省农业科学院经济作物研究所、山西省农业科学院农作物品种资源研究所、山西省农业科学院农作物品种资源研究所、山西省农业科学院农作物品种资源研究所、山西省农业科学院农作物品种资源研究所、山西省农业科学院农作物品种资源研究所、山西省农业科学院农作物品种资源研究所 |
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