《表2 芥菜TCP蛋白基序信息》

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《芥菜TCP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析》

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注：横线处为氨基酸同源性大于90%区域。

利用MEME网站对芥菜TCP家族进行基因序列的保守基序分析，所得结果见图2和表2。分析结果发现芥菜所有基因都含有TCP家族中最基本的motif 1，表2横线处为motif 1中氨基酸同源性大于90%区域，说明motif 1是TCP家族最重要的保守结构。TCP家族不同组内保守基序的分布有较大差异，ClassⅠ组的大部分基因的保守基序数量明显比ClassⅡ组的高。ClassⅠ组全部含有motif 1和motif2，且排列顺序都一样，说明这2个motif在ClassⅠ组内非常的保守；此外，一部分TCP蛋白含有特有的基序，如BjuTCP01～06特异性含有motif 9，BjuTCP07～20特异性含有motif 14，BjuTCP21～20特异性含有motif 5和motif 8，这些特异性的基序结构，可能与不同成员参与一些特定的调控过程有关。对于ClassⅡ组来说，CYC/TB1组中均含有motif13，而CIN亚组不含有motif 13但含有motif 6，且CIN含有的基序模块明显少于CYC/TB1，说明两个亚组存在显著的模块差异，可能影响两个亚组成员的功能。整体看来，大部分位于同一亚族的基因具有相似的保守基序，并表现出一定的排列规律，与前面的系统进化树的分类相吻合，不同亚族成员间的差异也为研究TCP家族中不同亚族的进化提供了参考。