《表2 拟南芥、玉米、水稻、番茄、大豆、小麦、大麦基因信息》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《玉米盐碱响应基因ZmERF1和ZmERF2的分子特性分析》
利用phytozome数据库(https://phytozome.jgi.doe.gov)下载ZmERF1和ZmERF2的蛋白序列,筛选与二者同源的来自不同物种的75条ERF蛋白,如表2所示,包括拟南芥52条ERF,水稻8条,玉米4条ERF,番茄6条,大豆1条,小麦1条,大麦3条。利用MEGA6.0软件对这些ERF蛋白进行序列比对[26],并用邻位(Neighbor-Joining)算法对77条ERF构建系统进化树,通过Bootstrap测试,重复设置1 000来保证进化树的可靠性。保守序列预测采用在线软件MEME(http://meme-suite.org/)进行预测,设置参数如下:预测数目:20;氨基酸数目:6~50;位点:2~600。
图表编号 | XD00160171900 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 程殿君、郭耀祖、吴庚锦、边境、徐晶宇、李佐同、贺琳 |
绘制单位 | 黑龙江八一农垦大学、黑龙江八一农垦大学、黑龙江八一农垦大学、黑龙江八一农垦大学、黑龙江八一农垦大学、黑龙江八一农垦大学、黑龙江八一农垦大学 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |