《表2 拟南芥、水稻和木薯基因的蛋白编号》

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《木薯SWEETs基因家族生物信息学及表达特性研究》


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根据17个拟南芥SWEET基因(AtSWEET)、21个水稻SWEET基因(OsSWEET)以及28个木薯SWEET基因(MeSWEET)的氨基酸序列(表2),利用MEGA4.0以及iTOL在线软件构建无根进化树(图2),总共分为4个簇。第1簇MeSWEET蛋白共有6个(MeSWEET1a-b,MeSWEET2a-b,MeSWEET3a-b),第2簇SWEET蛋白包含4个(MeSWEET4-7),第3簇SWEET蛋白共有12个,而第4簇中共包含6个MeSWEET蛋白(MeSWEET16a-c,MeSWEET17a-c)。通过对SWEET基因内含子、外显子分析发现(表1),除MeSWEET6和MeSWEET7含有5个外显子外,其余MeSWEET基因外显子数量是6个,MeS-WEET6和MeSWEET7分布在第2族,外显子的分布差异可能跟MeSWEET基因家族功能分化有关(图2)。