《表2 拟南芥、水稻和木薯基因的蛋白编号》
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《木薯SWEETs基因家族生物信息学及表达特性研究》
根据17个拟南芥SWEET基因(AtSWEET)、21个水稻SWEET基因(OsSWEET)以及28个木薯SWEET基因(MeSWEET)的氨基酸序列(表2),利用MEGA4.0以及iTOL在线软件构建无根进化树(图2),总共分为4个簇。第1簇MeSWEET蛋白共有6个(MeSWEET1a-b,MeSWEET2a-b,MeSWEET3a-b),第2簇SWEET蛋白包含4个(MeSWEET4-7),第3簇SWEET蛋白共有12个,而第4簇中共包含6个MeSWEET蛋白(MeSWEET16a-c,MeSWEET17a-c)。通过对SWEET基因内含子、外显子分析发现(表1),除MeSWEET6和MeSWEET7含有5个外显子外,其余MeSWEET基因外显子数量是6个,MeS-WEET6和MeSWEET7分布在第2族,外显子的分布差异可能跟MeSWEET基因家族功能分化有关(图2)。
图表编号 | XD0032491800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.25 |
作者 | 薛蓓蓓、覃丽芳、董明右、李有志、樊宪伟 |
绘制单位 | 广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学生命科学与技术学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室 |
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