《表2 RSH在拟南芥和水稻组织特异性表达及编码蛋白特性》

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《水稻OsRSH基因家族的生物信息学分析》


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本研究通过蛋白序列同源性分析、蛋白功能结构域分析以及系统进化分析,了解到在结构域、功能域和系统进化方面,水稻Os RSH与拟南芥AtRSH存在较高的相似性,据此可预测它们在功能上也应具有一定相似性。整理RSH在拟南芥和水稻组织特异性表达及编码蛋白特性情况总结如表所示(表2),根据水稻Os RSH基因具有的功能域,我们预测水稻Os RSH1可能只具有水解(p)ppGpp的功能,Os RSH2和Os RSH3可能具有(p)ppGpp水解酶活性和合成酶活性,Os CRSH1、Os CRSH2和Os CRSH3可能只具有(p)ppGpp合成酶活性。已知拟南芥AtRSH蛋白定位于叶绿体(Mizusawa et al.,2008),水稻Os CRSH1也定位于叶绿体(Tozawa et al.,2007),结合水稻Os RSH和拟南芥AtRSH都具有c TP区域(图1),我们预测水稻Os RSH可能定位并作用于叶绿体。水稻Os RSH很可能通过调控(p)ppGpp的水平参与植物叶绿体的重要生理过程,例如光合作用等。在ABA处理植物后,植物体内(p)ppGpp含量增加,而ABA处理后的水稻在整个植株中OsRSH2和OsRSH3都出现高表达,这可能是因为Os RSH2和Os RSH3具有合成酶活性,此时显示出来的合成酶活性远高于水解酶活性,所以才能增加植物体内ppGpp的含量。水稻Os RSH和拟南芥AtRSH在功能、结构和表达上可能都具有高度的相似性。