《表1 不同种系辣椒和拟南芥MYB家族各类型基因统计》

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《辣椒MYB基因家族的鉴定及与辣味关系分析》

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以拟南芥MYB转录因子蛋白质残基序列作为靶序列，与1年生辣椒CM334（C.annuum）基因组数据进行Blast分析（e值<1e–10），初步得到190个含有MYB基序或类MYB重复域的转录因子，通过Pfam、Bioedit的筛选验证最终得到172个MYB。同理，发现浆果状辣椒PBC81(C.baccatum）有159个MYB，黄灯笼辣椒PI159236(C.chinense）有167个MYB（表1）。根据MYB结构域重复数，将辣椒MYB分为1R、2R(R2R3）、3R、6R等不同类型，如C.annuum MYB有61个属于R1-MYB类，105个属于R2R3-MYB类，5个属于R1R2R3-MYB类（3R-MYB），1个为含6个重复基序的特殊蛋白，R2R3-MYB是MYB家族中数量最多的一组（表1）。