《表5 发生拷贝数变异基因簇及其最近同源基因簇的理化性质》

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《荠菜属CaCA家族基因拷贝数变异与表达分化的研究》

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鉴于荠菜CaCAs存在蛋白质序列和结构上的差异，本论文对相应蛋白质的理化性质进行了预测．结果显示，在氨基酸长度、分子量、等电点（pI）和平均亲水系数（GRAVY)4项指标上，在进化树中在同一个亚枝聚类的4个物种之间保守性较高，而不同亚枝之间存在明显的理化性质差异．在存在拷贝数变异的亚枝中，AtCAX5亚枝中的CbpCAX5a，CbpCAX5b和CbpCAX5c的氨基酸长度显著长于其亲本祖先，且其他指标也存在明显差异．而这3个拷贝内部也存在分化，其中CbpCAX5a和CbpCAX5b的所有指标均一致，而CbpCAX5c则呈现出更大的氨基酸长度、更高的等电点和更低的亲水系数．AtCCX3亚枝中仅有的一个CbpCCX3则更为特殊，它的氨基酸数目达942个，平均亲水系数仅为0.121（表5）．由此可以看出，CbpCaCAs中出现的拷贝数变异的基因簇成员在蛋白序列结构和蛋白质性质上出现了不同程度的分化，这提示了发生拷贝数变异的基因簇可能存在表达和功能上的分化．