《表3 不同长度重复单元微卫星所占比例及分布密度Table 3 Proportion and distribution density of nucleotide repeat types in SS
通过对测得的猕猴桃叶绿体基因组的序列进行微卫星查找,从总长为157 425 bp的猕猴桃叶绿体基因组中共查找出41个SSRs,占总基因组大小的0.3%。在该研究猕猴桃叶绿体基因组SSRs结果中,对多碱基重复的微卫星进行了统计,其中单碱基重复单元的SSR含量最多,为28个,约占SSR统计总数的68.3%,之后依次为二碱基重复单元,共8个,约占19.5%,三碱基重复单元和六碱基重复单元个数相同,分别约占SSR统计总数的4.9%,五碱基重复单元个数最少,只有1个,约占2.4%。通过分析SSR的分布密度发现单碱基重复丰度最高为187个·M-1,五碱基丰度最低为7个·M-1,平均3 840 bp出现1个微卫星,平均1 kbp出现0.27个SSR,其中由于不同重复单元微卫星数量差异较大,其分布密度变化也有较大差异,不同长度重复单元SSR所占比例及分布密度见表3。
图表编号 | XD001669500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.05.15 |
作者 | 吴东洋、业宁、徐逸卿、张礼、周小亮 |
绘制单位 | 南京林业大学林学院、南京林业大学信息科学技术学院、南京林业大学信息科学技术学院、南京林业大学信息科学技术学院、南京林业大学信息科学技术学院、南京林业大学信息科学技术学院 |
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