《表1 猪蛔虫全基因组不同类型微卫星碱基构成的数量分布》

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《猪蛔虫全基因组微卫星分布规律》

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通过MSDB搜索结果表明，在猪蛔虫全基因组序列中共有682个微卫星，其总长度为23 572 bp，出现频率为1/0.40 Mb，占全基因序列的8.67%。在这些微卫星类型中，其数量分布顺序为单碱基>二碱基>三碱基>四碱基>六碱基>五碱基（表1）。以单碱基重复为主，有405个，占总数的59.4%，其次是二碱基重复类型（161个，23.6%）和三碱基重复（61个，8.9%），五碱基重复最少（4个，0.6%）（图1） 。在这些微卫星重复类型中，单碱基重复类型最少有两种，二碱基和五碱基重复类型分别有4种，三碱基和六碱基重复分别有7种，四碱基重复类型最多，有10种。在这些重复单元中，（T） n（215个），（C） n（190个），（AT） n（118个），（AAT） n（41个），（AG） n（27个），（AAAT） n（22个），（AC） n（15个），（TTG） n（10个），（AGA） n（5个）数量最多（表1）。占全基因组微卫星数量的94.3%。