《表2 RNA-seq测序的可变剪接位点》

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《GmGBP1干涉转基因大豆种质创制及其对下游基因可变剪接的调控》

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对WT和GmGBP1-i-4大豆叶片转录组测序分析中发现一些基因发生了可变剪接，选取其中与开花时间相关的基因进行可变剪接验证（表2）。提取大豆总RNA，经1%的琼脂糖凝胶电泳检测，结果如图4所示，所得RNA均含有28S、18S、5S三种条带，说明所得RNA完整性较好。应用RT-PCR方法对WT与GmGBP1-i-4干涉大豆叶片转录组测序可变剪接结果[22]进行验证，结果表明Glyma13g19871（PRR7）、Glyma13g01810（CRY1）、Glyma04g07870（CRY3）这3个基因与野生型相比，GmGBP1干涉均引起了可变剪接的变化（图5）。GmGBP1干涉大豆叶片中Glyma13g19871基因前体mRNA中的剪接位点发生变化，该可变剪接类型为3'位点的可变剪接（外显子延伸）；Glyma13g01810基因前体mRNA发生可变剪接的类型为外显子跳跃；Glyma04g07870基因前体mRNA中发生可变剪接的类型为内含子保留。