《表1 可变剪接事件类型及基因数(个)》
RNA-seq原始数据经过质控后,每个样品均产生不低于5 GB的clean data,GC含量平均为85.9%且Q30>44.1%,测序数据满足后续分析。通过Tophat软件将clean data比对到绵羊参考基因组上,6个样品70%~84%的clean reads能比对到绵羊的参考基因组上。将经过Cufflinks软件组装的转录本与绵羊参考基因组进行比较,对照组鉴定出可变剪接事件为8 527个,实验组鉴定出可变剪接事件为6 212个,其中已注释的可变剪接由1 321下降为959个,新的可变剪接数目由7 206下降为5 253个;可变剪接事件归类分析显示IR事件为最多的可变剪接事件,约占29.3%,其次为A3SS、A5SS和ES(见表1)。
图表编号 | XD0068137800 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.08.20 |
作者 | 邓秀玲、王海生、叶纪诚、张建宇、孙计桃、苑红 |
绘制单位 | 内蒙古医科大学基础医学院、内蒙古医科大学基础医学院、内蒙古医科大学基础医学院、内蒙古医科大学基础医学院、内蒙古医科大学基础医学院、内蒙古医科大学基础医学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |