《表1 可变剪接事件类型及基因数(个)》

《表1 可变剪接事件类型及基因数(个)》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《疼痛应答中背根神经节可变剪接的鉴定与分析》


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RNA-seq原始数据经过质控后,每个样品均产生不低于5 GB的clean data,GC含量平均为85.9%且Q30>44.1%,测序数据满足后续分析。通过Tophat软件将clean data比对到绵羊参考基因组上,6个样品70%~84%的clean reads能比对到绵羊的参考基因组上。将经过Cufflinks软件组装的转录本与绵羊参考基因组进行比较,对照组鉴定出可变剪接事件为8 527个,实验组鉴定出可变剪接事件为6 212个,其中已注释的可变剪接由1 321下降为959个,新的可变剪接数目由7 206下降为5 253个;可变剪接事件归类分析显示IR事件为最多的可变剪接事件,约占29.3%,其次为A3SS、A5SS和ES(见表1)。