《表3 幼年德保矮马和幼年蒙古马垂体中发生差异可变剪接的基因》
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《基于差异可变剪接的德保矮马垂体内体高相关基因的筛选》
RNA-seq结果显示,幼年德保矮马与幼年蒙古马相比,垂体中发生差异可变剪接的基因共23种,分别位于马的1、3、4、5、6、7、8、14、15、18、19、20、24号染色体,差异的可变剪接类型以cassette exon和A3SS为主(图1,表3)。通过GO分析,23种发生差异可变剪接的基因被富集到41个分子功能条目、258个生物过程条目和54个细胞组分条目。其中,具有统计学意义(P<0.05)的条目涉及磷脂酰甘油结合(GO:1901611)、甲状腺激素受体结合(GO:0046966)、多细胞生物发育调节(GO:2000026)、细胞外信号调节蛋白激酶(extracellular signal-regulated protein kinase,ERK)1和ERK2级联调节(GO:0070372)、晚期内体(GO:0005770)和轴突初始片段(GO:0043194)等(图2)。KEGG通路富集分析显示,发生差异可变剪接的基因被富集到细胞粘附分子、柠檬酸循环、糖鞘脂生物合成-乳糖与新乳糖系列、色氨酸代谢等22条通路(图3)。
图表编号 | XD0071965500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 潘静、房君、刘春霞、曹俊伟、邢燕平、周欢敏、张焱如 |
绘制单位 | 内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室 |
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