《表2 Srsf1敲低导致的显著可变剪接事件和显著差异基因》
使用剪接分析软件r MATS处理RNA-seq数据,得到两个样本间存在显著差异的可变剪接事件共839个,发生显著差异可变剪接的基因共719个,绝大多数基因发生外显子跳跃类型的可变剪接(表2)。对所有显著差异可变剪接基因进行KEGG通路分析(图4),结果显示共富集到12个信号通路,其中已知与性发育相关的通路只有MAPK信号通路,共14个基因富集到该通路,其中13个基因发生的可变剪接事件类型是外显子跳跃(SE) ,1个基因发生的可变剪接事件类型是可变3'剪接位点。
图表编号 | XD0075524500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.30 |
作者 | 朱豆豆、陈利、徐园、李凯、周宇荀、肖君华 |
绘制单位 | 东华大学化学化工与生物工程学院、东华大学化学化工与生物工程学院、东华大学化学化工与生物工程学院、东华大学化学化工与生物工程学院、东华大学化学化工与生物工程学院、东华大学化学化工与生物工程学院 |
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