《表2 Ah FATs基因可变剪接事件分析》
注:TSS:转录起始位点可变剪接;TTS:转录终止位点可变剪接;AE:外显子5'或3'端剪接。
根据转录组数据对Ah FAT的可变剪接事件进行预测,结果表明,在19个Ah FATs中,有5个具有可变剪接现象,仅占26%(表2)。发生可变剪接的类型也较少,只有转录起始位点可变剪接(TSS)、转录终止位点可变剪接(TTS)和外显子末端可变剪接(AE)。TSS发生频率最高,有12次;其次是TTS,有6次;AE仅发生3次。不同AhFAT的可变剪接具有明显的差异。Ah FATA亚家族的两个基因在四个组织中都发生了可变剪接。Aradu.J7RE1和Araip.D1M07都发生了TSS和TTS,其中基因Aradu.J7RE1还发生了AE。AhFATB家族基因虽然多,但是大多都没有发生可变剪接,只有Araip.SBA9Y、Aradu.ZG6C0和Aradu.8Y7VD发生了可变剪接,仅占16.7%;其中Araip.SBA9Y和Aradu.ZG6C0均发生了TSS,Aradu.8Y7VD发生了AE和TTS。
图表编号 | XD00183275500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.30 |
作者 | 张会、单雷、李新国、郭峰、孟静静、万书波、彭振英 |
绘制单位 | 山东省农业科学院生物技术研究中心、山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室、山东省农业科学院生物技术研究中心、山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室、山东省农业科学院生物技术研究中心、山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室、山东省农业科学院生物技术研究中心、山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室、山东省农业科学院生物技术研究中心、山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室、山东省农业科学院、山东省农业科学院生物技术研究中心、山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室 |
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