《表6 幼年和成年蒙古马垂体中发生差异可变剪接的基因》
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《基于差异可变剪接的德保矮马垂体内体高相关基因的筛选》
通过对测序结果的分析发现,幼年德保矮马与成年德保矮马相比,垂体中发生差异可变剪接的基因共5种,分别位于马的1、2、3、5号染色体上,差异的可变剪接类型包括A5SS、ES和IntronR(图1,表5)。通过GO分析,5种发生差异可变剪接的基因被富集到29个分子功能条目、127个生物过程条目和11个细胞组分条目。其中,具有统计学意义(P<0.05)的条目涉及碱性螺旋-环-螺旋(basic helixloop-helix,bHLH)转录因子结合(GO:0043425)、丝裂原活化蛋白激酶激酶结合(GO:0031434)、磷酸化正调节(GO:0042327)、骨细胞发育(GO:0098751)、信使核糖核蛋白复合物(GO:1990124)和核转录因子复合物(GO:0044798)等(图5)。通过KEGG通路富集分析,发生差异可变剪接的基因被富集到背腹轴形成、造血细胞谱系、磷脂酶D信号通路等14条通路(图6)。而幼年蒙古马与成年蒙古马相比,垂体中发生差异可变剪接的基因共8种,分别位于马的2、3、4、7、8、14、15、24号染色体,差异的可变剪接类型以cassette exon和A3SS为主(图1,表6)。通过GO分析,8种发生差异可变剪接的基因被富集到了19个分子功能条目、79个生物过程条目和10个细胞组分条目。其中,具有统计学意义(P<0.05)的条目涉及ephrin受体活性(GO:0005003)、PDZ结构域结合(GO:0030165)、神经生长因子信号通路(GO:0038180)、环磷酸腺苷反应元件结合蛋白(cAMP responsive element binding protein,CREB)转录因子活性正调节(GO:0032793)、细胞质核周区域(GO:0048471)和粗面内质网(GO:0005791)等(图7)。通过KEGG通路富集分析,发生差异可变剪接的基因被富集到黏合连接、轴突导向、神经营养因子信号等11条通路(图8)。
图表编号 | XD0071965300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 潘静、房君、刘春霞、曹俊伟、邢燕平、周欢敏、张焱如 |
绘制单位 | 内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古生物制造重点实验室 |
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