《表2 绵羊胎儿组与成年羊组肌肉组织差异剪接基因的KE-GG通路分析》

《表2 绵羊胎儿组与成年羊组肌肉组织差异剪接基因的KE-GG通路分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《绵羊不同发育阶段背最长肌组织中可变剪接的鉴定与分析》


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基因组中差异可变剪接会导致细胞组成和功能的差异。本研究采用rMATS软件鉴定可变剪接事件及差异剪接基因,在妊娠90日龄与出生后30日龄、妊娠90日龄与成年3岁绵羊以及出生后30日龄与成年3岁绵羊背最长肌组织比较组中分别鉴定到了2 545,2 689和1 701个差异剪接基因。从研究结果可以看到出生前后背最长肌组织的可变剪接事件存在差异,由此可见可变剪接具有发育阶段特异性,且可变剪接在出生前的行动更活跃,这是与哺乳动物出生前主要是肌纤维数量的增加,出生后则是肌纤维的增长和变粗有密切关系[37]。本研究可变剪接事件中SE事件的数量是最多的,这与前人的研究一致[38],说明SE是生物体中最普遍发生的可变剪接事件。对差异剪接基因进行功能富集分析,GO显著富集到了与肌肉发育相关通路上且共同富集到细胞内部分(GO:0044424),参与细胞内物质合成,KEGG共同富集到了胞吞作用、胰岛素信号通路、焦点粘连、泛素介导的蛋白水解4条信号通路上,这些信号通路与肌肉发育密切相关,表明可变剪接在绵羊背最长肌的发育过程中发挥重要作用。差异可变剪接基因与差异表达基因不一样,本研究中约26%的差异可变剪接基因的表达水平是差异的,说明差异可变剪接基因与差异表达基因各自发挥功能共同维持细胞生命活动[39]。