《表2 KEGG通路分析：基于中值的JS散度可变剪接差异分析研究》

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《基于中值的JS散度可变剪接差异分析研究》

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分别选取Gene Model和AS Model在3种癌症中排名靠前500的差异基因，使用在线网站KOBAS3.0（http://kobas.cbi.pku.edu.cn）对这些差异基因分别进行KEGG通路分析，来比较Gene Model和AS Model的差异基因在生物学上的通路富集情况。分别按显著性选取排名靠前10的通路进行分析，结果如表2所示。由表2可知，Gene Model的差异基因在3种癌症中主要富集了在与癌症相关的通路，如癌症通路、Rap1信号通路、cAMP信号通路、AMPK信号通路等通路。而AS Model差异基因在3种癌症中的共同的通路有细胞周期通路、代谢通路、p53信号通路。已有的研究表明，癌症的产生及恶化与细胞周期的失调密切相关，细胞周期失调导致细胞增生[14]。基于可变剪接差异基因在细胞周期通路的富集表明：可变剪接对细胞周期的精细调控具有重要影响。研究这些剪接异构体相应的蛋白质对细胞周期的影响将有助于癌蛋白质亚型水平破译癌症等复杂疾病的产生机制。对于代谢通路，是由于可变剪接通过控制某些剪接异构体相应的蛋白质表达量，进而调控改变原有的新陈代谢以驱动肿瘤发生。且Inoue等人[15]发现p53信号通路中抑癌基因的异常剪接会促进肿瘤发生。