《表1 桑树b HLH转录因子家族的鉴定及特征》
利用HMMER3.0和本地Blast软件对桑树全基因组蛋白序列进行检索,同时手动剔除重复序列,只保留一个HLH结构域的蛋白序列。最后得到173个只具有一个HLH结构域的转录因子家族成员,与氨基酸大小、分子量和等电点等信息(表1)。桑树bHLH转录因子家族成员蛋白序列含有氨基酸数目为91(XP_010092048.1,XP_010108968.1)~1 062(XP_010-090380.1,XP_010099295.1),利用Expasy软件预测桑树bHLH分子量大小为10 257.6(XP_010092048.1)~118 943.11 Da(XP_010090380.1),等电点为4.585 2(XP_010107083.1)~10.338 3(XP_010107204.1)。从以上理化性质来分析,桑树bHLH转录因子家族成员之间的各项指标跨度较大,具有差异性,在筛选出的173个转录因子家族成员中,有102个转录因子的等电点小于7,占59.1%,呈弱酸性。
图表编号 | XD0087037300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.14 |
作者 | 李辰晖 |
绘制单位 | 西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室、西南林业大学西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |