《表1 ZmWOX转录因子家族的特征》

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《玉米WOX家族基因的鉴定与分析》


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利用Pfam数据库(http://pfam.sanger.ac.uk/)搜索关键词“WOX”,获得登录号为“PF00046”的序列。以“PF00046”为搜索序列在PlantTFDB和NCBI中进行Blastp,共获得58个候选基因。清除结果中重复的基因,一共得到31个候选基因,将这31个候选基因在InterPro中进行验证,结果显示,这31个基因编码的蛋白都具有两个完整的HOX结构域。将氨基酸长度、CDs长度、理论等电点、蛋白分子量、亚细胞定位以及基因在染色体上的位置信息数据保存制作成表格(表1)。对鉴定的玉米WOX家族成员的理化性质进行分析发现,各个成员的理化性质均存在差异,氨基酸长度介于192~842 aa之间,理论等电点介于5.660 2~11.004 6之间,蛋白质分子量则介于17 479.7~92 379.5 Da之间。亚细胞定位结果发现,只有ZmWOX19除了定位在核中,还可能定位在叶绿体中,其余30个WOX家族基因均只定位在细胞核中。