《表1 桑树b HLH转录因子家族的鉴定及特征》

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《桑树bHLH转录因子家族全基因组鉴定与分析》


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利用HMMER3.0和本地Blast软件对桑树全基因组蛋白序列进行检索,同时手动剔除重复序列,只保留一个HLH结构域的蛋白序列。最后得到173个只具有一个HLH结构域的转录因子家族成员,与氨基酸大小、分子量和等电点等信息(表1)。桑树bHLH转录因子家族成员蛋白序列含有氨基酸数目为91(XP_010092048.1,XP_010108968.1)~1 062(XP_010-090380.1,XP_010099295.1),利用Expasy软件预测桑树bHLH分子量大小为10 257.6(XP_010092048.1)~118 943.11 Da(XP_010090380.1),等电点为4.585 2(XP_010107083.1)~10.338 3(XP_010107204.1)。从以上理化性质来分析,桑树bHLH转录因子家族成员之间的各项指标跨度较大,具有差异性,在筛选出的173个转录因子家族成员中,有102个转录因子的等电点小于7,占59.1%,呈弱酸性。