《表1 黑果枸杞b HLH转录因子的理化性质》

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《NaCl胁迫下黑果枸杞bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析》


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根据盐胁下黑果枸杞转录组测序数据,在NR、KOG和Swiss-Prot 3个数据库进行注释,初步注释到252个b HLH转录因子相关基因。利用NCBI Blast和SMART进一步对这252个基因对应蛋白质进行分析,除去冗余和重复基因,最终确定黑果枸杞在盐胁迫下,b HLH转录因子家族相关基因共有89个,命名为Lrb HLH01~Lrb HLH89(表1)。从RNA序列中提取对应蛋白序列起始密码序列和终止密码序列,根据起始密码子和终止密码子特性,判断出29条蛋白序列是全长序列,即29个基因具有完整的ORF。