《表3 西瓜全基因组YUCCA基因家族的基本信息》
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《西瓜YUCCA基因家族鉴定及在果实成熟过程中的表达分析》
通过西瓜基因组数据库BLASTP搜索,最终在西瓜基因组鉴定出10个YUCCA基因,这10个YUCCA基因的氨基酸数量由211个到793个不等,分子量大小从23.13 kDa到88.68 kDa(表3)。构建西瓜和拟南芥的系统发育树,并根据与拟南芥YUCCA基因的进化关系命名,Cl YUCCA10有3个同源基因,根据其与At YUCCA10氨基酸序列的相似性,分别命名为Cl YUCCA10a(58.70%)、Cl YUCCA10b(36.20%)、Cl YUCCA10c(26.30%)。拟南芥和西瓜的YUCCA基因可以分为两类,第一类又可以分为两个亚类,At YUCCA3、AtYUCCA5、AtYUCCA7、AtYUCCA8、AtYUCCA9和Cl YUCCA3、Cl YUCCA8、Cl YUCCA9为一个亚类,At YUCCA1、At YUCCA2、At YUCCA4、At YUCCA6和Cl YUCCA2、Cl YUCCA4、Cl YUCCA6为另一个亚类;第二类则由At YUCCA10、AtYUCCA11和ClYUCCA10a、ClYUCCA10b、Cl YUCCA10c、Cl YUCCA11组成,这些聚为一类的YUCCA基因可能在功能上更相近(图3)。
图表编号 | XD0062289400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.01 |
作者 | 张倩倩、田守蔚、张洁、王艳萍、孙宏贺、任毅、郭绍贵、宫国义、许勇、张海英 |
绘制单位 | 北京农学院植物科学技术学院、北京市农林科学院蔬菜研究中心农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室蔬菜种质改良北京重点实验室、北京市农林科学院蔬菜研究中心农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室蔬菜种质改良北京重点实验室、北京市农林科学院蔬菜研究中心农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室蔬菜种质改良北京重点实验室、北京市农林科学院蔬菜研究中心农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室蔬菜种质改良北京重点实验室、北京市农林科学院蔬菜研究中心农业农村部华北地区园艺 |
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