《表3 西瓜全基因组YUCCA基因家族的基本信息》

《表3 西瓜全基因组YUCCA基因家族的基本信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《西瓜YUCCA基因家族鉴定及在果实成熟过程中的表达分析》


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通过西瓜基因组数据库BLASTP搜索,最终在西瓜基因组鉴定出10个YUCCA基因,这10个YUCCA基因的氨基酸数量由211个到793个不等,分子量大小从23.13 kDa到88.68 kDa(表3)。构建西瓜和拟南芥的系统发育树,并根据与拟南芥YUCCA基因的进化关系命名,Cl YUCCA10有3个同源基因,根据其与At YUCCA10氨基酸序列的相似性,分别命名为Cl YUCCA10a(58.70%)、Cl YUCCA10b(36.20%)、Cl YUCCA10c(26.30%)。拟南芥和西瓜的YUCCA基因可以分为两类,第一类又可以分为两个亚类,At YUCCA3、AtYUCCA5、AtYUCCA7、AtYUCCA8、AtYUCCA9和Cl YUCCA3、Cl YUCCA8、Cl YUCCA9为一个亚类,At YUCCA1、At YUCCA2、At YUCCA4、At YUCCA6和Cl YUCCA2、Cl YUCCA4、Cl YUCCA6为另一个亚类;第二类则由At YUCCA10、AtYUCCA11和ClYUCCA10a、ClYUCCA10b、Cl YUCCA10c、Cl YUCCA11组成,这些聚为一类的YUCCA基因可能在功能上更相近(图3)。