《表1 西瓜CIPK家族基因命名》

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《西瓜CIPK家族基因的鉴定与特征分析》


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注:a代表CIPK家族基因在Charleston Gray品种中的编号;b代表CIPK家族基因在97103品种中的编号。Note:arepresent CIPKfamily genes are numbered in Charleston Gray breed;b represent CIPKfamily genes are numbered in 97103breed.

该研究利用生物信息学的分析方法,从西瓜基因组数据库中共检索出19条CIPK蛋白,按照它们在染色体上的分布和排列顺序依次命名为ClCIPK1~ClCIPK19,CIPK蛋白家族成员含有330~565个氨基酸。19个CIPK基因不均衡地分布在1、2、3、4、5、6、8、10号染色体上,个数为1、2、3、4个不等,其余染色体上不存在CIPK基因。分子量及等电点等理化性质分析发现,其等电点范围从6.08(ClCIPK12)到9.20(ClCIPK8),分子量介于38 210.98(ClCIPK15)和63 922.55(ClCIPK5)之间(表1),通过比对19个ClCIPK基因的NAF结构域,发现所有蛋白序列均含有NAF结构域(除了ClCIPK9),同时还有3个氨基酸,分别是I、S和L,这3个氨基酸在所有西瓜CIPK编码蛋白中是非常保守的(图1),很可能这些氨基酸在西瓜的CIPKs与CBLs互作中起着至关重要的作用。