《表1 西瓜CIPK家族基因命名》
注:a代表CIPK家族基因在Charleston Gray品种中的编号;b代表CIPK家族基因在97103品种中的编号。Note:arepresent CIPKfamily genes are numbered in Charleston Gray breed;b represent CIPKfamily genes are numbered in 97103breed.
该研究利用生物信息学的分析方法,从西瓜基因组数据库中共检索出19条CIPK蛋白,按照它们在染色体上的分布和排列顺序依次命名为ClCIPK1~ClCIPK19,CIPK蛋白家族成员含有330~565个氨基酸。19个CIPK基因不均衡地分布在1、2、3、4、5、6、8、10号染色体上,个数为1、2、3、4个不等,其余染色体上不存在CIPK基因。分子量及等电点等理化性质分析发现,其等电点范围从6.08(ClCIPK12)到9.20(ClCIPK8),分子量介于38 210.98(ClCIPK15)和63 922.55(ClCIPK5)之间(表1),通过比对19个ClCIPK基因的NAF结构域,发现所有蛋白序列均含有NAF结构域(除了ClCIPK9),同时还有3个氨基酸,分别是I、S和L,这3个氨基酸在所有西瓜CIPK编码蛋白中是非常保守的(图1),很可能这些氨基酸在西瓜的CIPKs与CBLs互作中起着至关重要的作用。
图表编号 | XD001654300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.04.30 |
作者 | 栾非时、吕慧玲、朱子成、张辰、林凡、韩前坤 |
绘制单位 | 东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 |
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