《表1 番木瓜ERF家族成员的命名》
从转录因子数据库PlantTFDB网站下载了77个番木瓜ERF家族成员的基因及蛋白序列,与模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和番茄(Solanum lycopersicum)ERF家族成员进行同源比对,进而命名(表1)。番木瓜ERF家族蛋白长度分布在127~638 aa之间,理论分子量为14 077.6~71 276 Da(相对分子质量最小的是CpERF5a;最大的是CpPLT2),等电点(pI)为4.3653~10.7116之间,其中有38个成员pI小于7,显酸性;33个成员pI大于7,显碱性,有6个成员pI在7~8之间,偏中性;总体平均pI值为7.27,呈中性。对于整个ERF家族成员来说,不同亚族不同成员之间的蛋白长度、相对分子质量跟等电点都不同,但是Ⅵ亚族的4个基因(CpCRF2、CpCRF6a、CpPTI6和CpCRF6b)的蛋白长度(264~353 aa)和等电点(4.474~5.842)相差不大,都显酸性,推测该亚族的基因在酸性的亚细胞环境下能发挥较好的作用。
图表编号 | XD0061567900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.25 |
作者 | 陈永萍、高峰、申艳红、赵湾湾、陈桂信、王平 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺学院、福建农林大学生命科学学院、河北科技师范学院园艺科技学院、福建农林大学园艺学院园艺植物遗传育种研究所、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院园艺植物遗传育种研究所 |
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