《表1 CsWOX基因家族基因的特征》

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《茶树WOX基因家族的鉴定和表达模式分析》


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通过2次比对搜索以及将比对的候选基因提交到SMART、Pfam、NCBI-CDD等在线网站进行保守域的结构验证,最终得到了29个茶树WOX基因,并根据基因在染色体的位置及其同源关系对其命名。进一步对茶树WOX基因编码的蛋白质进行理化性质分析(表1),结果显示,茶树最长的WOX蛋白CsWOX27含有55 342个氨基酸残基,最短的CsWOX13含有476个氨基酸残基;相对分子量在14.7 (CsWOX13)~93.1 k D (CsWOX28);理论等电点(Pi)介于5.53 (CsWOX03)~9.97(CsWOX10)之间,同时发现Pi>7的CsWOX蛋白达到了65.52%(19个),表明大部分CsWOX蛋白富含碱性氨基酸。