《表1 油菜SOD基因家族的特征》

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《油菜超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析》


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通过使用Pfam数据网站中的隐马氏模型(PF00-080,PF00081,PF02777)进行SOD蛋白查找,通过SM-ART和CDD对发现的蛋白质序列的结构域进行检测,最终获得32个油菜籽的SOD蛋白质序列。以染色体的位置命名,分别为BanSOD1~BanSOD15(表1)。通过对基因序列分析表明,基因存在较大差异:编码SOD蛋白的氨基酸长度范围为152 aa~318 aa,开放阅读框从1 042 bp(BanSOD15)到3 566 bp(BanSOD17),分子量范围从15.14 bp(BanSOD27)到34.21 bp(BanSOD2),等电点范围从4.52 bp(BanSOD23)到9.65 bp(BanSOD1)。