《表1 SbWRKY基因家族基本信息》

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《高粱WRKY家族成员鉴定及生物信息学分析》

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注:下划线部分表示该WRKY转录因子蛋白的WRKYGQK保守结构域发生变异或锌指结构特殊

利用ClustalX 2.1软件对97个SbWRKY转录因子蛋白序列进行多重比对分析，依据Eulgem等（2000）对WRKY蛋白的分类依据对97个蛋白的保守结构域进行鉴定分析和分类，其中有16个SbWRKY转录因子蛋白的七肽结构域或锌指结构发生了变异（表1）。进化树结果显示，SbWRKY蛋白家族各组和各亚组蛋白序列聚类结果同保守结构域鉴定的结果一致。每个组单独类聚在一起，高粱SbWRKY转录因子家族蛋白亦可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三大类。Ⅰ类的成员类聚在起始的大分支上，Ⅱ类成员类聚在一个次级分支，而Ⅲ类成员则类聚在Ⅱ类的下级分支上，由此从进化关系上可以看出高粱中Ⅱ和Ⅲ类是由Ⅰ类进化而来的（图2）。