《表2 石榴ARF基因家族的基本信息》

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《石榴ARF基因家族鉴定及表达分析》

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从Pfam数据库中下载ARF基因家族的序列比对文件（PF06507），将比对文件转换格式后，用SelectHMM（https://github.com/Redpome/SelectHMM）筛选石榴蛋白序列中含有该结构域的序列，基于E-value≤10-10。一共从基因组中鉴定出可能的21个石榴ARF基因家族候选成员，但其中有2个（CDL15＿Pgr010921和CDL15＿Pgr016635）因不含有ARF保守结构域或结构序列不完整被除去，因此最终鉴定出19个可能的石榴ARF基因家族成员。将石榴ARF基因家族成员与模式植物拟南芥进行同源比对分析后，寻找拟南芥中的直系同源基因，按照最匹配的结果来对石榴ARF基因家族成员进行排序命名，详情见表2。