《表2 GmANKTM家族基因基本信息》

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《大豆GmANKTM家族非生物胁迫生物信息学分析》


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从大豆中鉴定出62个GmANKTM家族基因,命名为GmANKTM1-GmANKTM62,根据进化关系及结构域相近度将其划分为5个亚家族(见图1A)。由表2可知,GmANKTM家族基因编码蛋白含346~1 039个氨基酸,预测分子质量为37.88~114.83 ku,等电点(pI)为4.46~9.61。大豆ANKTM家族蛋白包含1~9个ANK基序和1~2个C末端跨膜结构域。GmANKTM家族基因含ANK基序数量不等且位置有差异。除GmANKTM57和GmANKTM58外,其余基因跨膜结构域均位于C末端。除ANK结构域和跨膜结构域外,还有6种结构域(见图1B)。53个成员含PGG结构域、4个成员含SBP结构域、3个成员含锌指结构域、2个成员含DUF4219结构域、1个成员含有G-PCR结构域、1个成员含有ACBP结构域、1个成员含有cNMP结构域、1个成员含Iron trans结构域(见图1B)。GmANKTM家族基因最少含3种结构域,最多含4种结构域。同一亚家族中蛋白结构域分布位置和种类相近。除ANK基序、跨膜结构域和PGG结构域外其余结构域大部分集中在第5亚家族,第2亚家族有少量分布。这些不同结构域赋予ANKTM家族蛋白特异性结合不同底物蛋白质的能力,使基因功能具有多样性。