《表1 菜豆TIFY家族基因的基本信息》

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《菜豆TIFY基因的全基因组鉴定与系统进化分析》


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基于局部比对方法,本研究从菜豆基因组中鉴定出18个TIFY基因,具体BLAST的参数:期望值为1e-10,其它参数默认。接下来,利用Pfam在线工具对这些基因编码的TIFY蛋白进行结构域剖析,结果显示:18个菜豆TIFY蛋白均包含一个典型的TIFY结构域(IPR010399或PF06200),其核心保守模体为TIFYXG。此外,为详细研究这些菜豆TIFY基因,笔者整理出这些基因在染色体上的起点和终点、正负链以及基因登录号(表1)。