《表1 栽培花生Aux/IAA家族基因信息》

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《栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析》


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本研究采用HMMER和BlastP两种方法对花生A基因组和B基因组进行Aux/IAA蛋白检索,经过保守结构域检测,共获得了34条Aux/IAA蛋白序列各17条,分别来源于A基因组和B基因组。为方便后续分析,将这些基因分别命名为AdIAA1-17和AiIAA1-17。对栽培花生Aux/IAA蛋白序列信息进行整理发现,这些氨基酸序列长度在长度分布在135~397 aa之间,分子质量为15 296.47~43 608.34 Da,等电点预测在4.89至9.39范围内,所有的Aux/IAA蛋白预测定位于细胞核(表1)。