《表1 油棕Aux/IAA家族基因信息》

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《油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析》

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注:+:染色体正链；-:染色体负链

本研究利用拟南芥和水稻Aux/IAA基因家族的蛋白序列对油棕蛋白组数据进行了BLASTp检索，经过Pfam保守结构域检测，共获得55个基因家族成员（表1）。为方便后续研究，根据基因顺序对其命名为Eg IAA1～Eg IAA55。对其蛋白序列进行预测发现，油棕Aux/IAA蛋白的氨基酸数量分布范围为99～1 129 aa，平均值为540.67 aa，分子量在11 550.2～125 926.4 Da之间，理论等电点变化范围为4.81～9.33，其中p I<7的占82%，亚细胞定位显示Eg IAA3、Eg I-AA9、Eg IAA10、Eg IAA33、Eg IAA37、Eg IAA47蛋白定位在叶绿体上，Eg IAA6和Eg IAA13蛋白定位在线粒体上，Eg IAA20、Eg IAA49蛋白定位在细胞质，其余皆定位于细胞核内。