《表1 Aux/IAA家族蛋白特征》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《普通烟草Aux/IAA转录因子家族全基因组鉴定分析Aux/IAA》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

基于隐马尔科夫模型序列谱，从烟草基因组数据库中共检索得到84条候选基因序列，通过Pfam数据库对候选序列进行结构域分析，剔除不含Aux/IAA同源异型结构域的序列，最终得到77个烟草Aux/IAA家族基因，按照NtIAA1～NtIAA77的顺序对每个基因依次进行编号（见表1）。通过Pfam数据库进行结构域分析结果显示，在77个基因中，只包含Aux/IAA结构域的有56个基因；同时包含Aux/IAA和ARF结构域的有21个基因，这21个基因同样也属于ARF家族；同时包含Aux/IAA、ARF和B3结构域的有15个基因，这15个基因同样也属于B3超家族；分析Aux/IAA家族成员的理化性质发现，平均氨基酸长度为379，范围在72～1104之间；平均分子量为42191.17 kDa，范围在8119.66～121828.27之间；平均等电点为6.74，范围在4.31～9.65之间，其中酸性蛋白（等电点小于7）有51个，碱性蛋白（等电点大于7）有26个；平均脂肪族氨基酸指数为71.95，范围在59.5～92.08之间；平均疏水性指数为-0.559，范围在-0.106～-1.244之间，该家族蛋白全部表现为亲水性。