《表2 花生Ah COL基因家族鉴定》

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《花生CONSTANS-Like(COL)家族基因的克隆与表达分析》


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利用花生基因组数据库(Peanutbase)共检索到65个COL基因,与NCBI等在线工具查找65个AhCOL基因的编码区开放阅读框,最终克隆出17个Ah COL基因(图1)并命名为Ah COL1-Ah COL17。对其基因名称、染色体位置、氨基酸序列、分子量、等电点和功能进行比较分析(表2)发现,COL3和COL4编码氨基酸长度最短,为327 aa,分别位于20和10号染色体上;COL2、COL9和COL16编码氨基酸长度均为432 aa,分别位于6号、3号和16号染色体上;COL17编码的氨基酸长度最长,为617 aa,位于19号染色体上。Ah COL蛋白分子量范围为35 690.76~69 482.43 Da,等电点范围为4.82(COL1)~6.96(COL14),且均小于7,表明Ah COL基因很有可能编码酸性蛋白,在碱性亚细胞环境中发挥的作用较小。