《表2 花生Ah COL基因家族鉴定》
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《花生CONSTANS-Like(COL)家族基因的克隆与表达分析》
利用花生基因组数据库(Peanutbase)共检索到65个COL基因,与NCBI等在线工具查找65个AhCOL基因的编码区开放阅读框,最终克隆出17个Ah COL基因(图1)并命名为Ah COL1-Ah COL17。对其基因名称、染色体位置、氨基酸序列、分子量、等电点和功能进行比较分析(表2)发现,COL3和COL4编码氨基酸长度最短,为327 aa,分别位于20和10号染色体上;COL2、COL9和COL16编码氨基酸长度均为432 aa,分别位于6号、3号和16号染色体上;COL17编码的氨基酸长度最长,为617 aa,位于19号染色体上。Ah COL蛋白分子量范围为35 690.76~69 482.43 Da,等电点范围为4.82(COL1)~6.96(COL14),且均小于7,表明Ah COL基因很有可能编码酸性蛋白,在碱性亚细胞环境中发挥的作用较小。
图表编号 | XD00228893400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.01 |
作者 | 胡冬秀、刘浩、鲁清、李海芬、方加海、梁炫强 |
绘制单位 | 广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中心广东省农作物遗传改良重点实验室、江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室、广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中心广东省农作物遗传改良重点实验室、广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中心广东省农作物遗传改良重点实验室、广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中心广东省农作物遗传改良重点实验室、江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室、广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中 |
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