《表1 大白菜Br NPR家族基因鉴定》

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《大白菜NPR家族基因鉴定及表达模式分析》


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以拟南芥At NPR1 (AT1G64280)、At NPR2 (AT4G-26120)、At NPR3 (AT5G45110)、At NPR4 (AT4G19660)、At NPR5 (AT2G41370)和At NPR 6 (AT3G57130)的蛋白质序列为参考序列,在大白菜基因组网站Brassica database中进行蛋白序列比对,经过基因及蛋白结构筛选后共得到11个大白菜NPR家族基因。根据蛋白序列相似性及系统进化关系分别将他们命名(表1)。11个Br NPR基因外显子数目由1~5个不等。11个基因序列长度范围在876 bp和2 326 bp之间;CDS序列长度范围876 bp到1 767 bp;蛋白序列长度范围为291~605 aa,蛋白分子量大小范围从32.60~67.87 k D不等(表1)。大白菜NPR家族蛋白等电点范围为5.92到7.47,其中只有Br NPR3B等电点大于7,偏碱性,其余13个基因蛋白质等电点均小于7,偏酸性(表1)。