《表1 美国白蛾热激蛋白家族基因筛选与鉴定结果》
在美国白蛾基因组注释信息中,共筛选到29条与HSP相关的序列信息,其中有9条为不符合筛选目的的序列,包括HSP-binding protein、分子量大小不符合以及经过NCBI-Blast后同源性极低的序列。经过滤不符合要求的信息后,共获得20个美国白蛾HcunHSP家族基因(见表1),包括:8个HSP20s、7个HSP40s、4个HSP70s和1个HSP90。此外,鉴定得到的HcunHSP70中,有3个HcunHSP70(Gene ID分别为:EVM0013579、EVM0003299、EVM0000698)均包含已报道的HSP70特有序列IDLGTTYS、IFDLGGGTFDVSIL、VV-LVGGSTRIP[5]。HcunHSP90(Genen ID:EVM0012516)包含了YSNKEIFLRE、LGTIAKSGT、IKLYVRRVFI、GV-VDSEDLPLNISR 4条HSP90特有序列[5]。7个HcunHSP40基因均为DnaJ homolog,且均与家蚕(Bombyx mori)的BmorDnaJ(HSP40)同源性匹配度高,除了EVM0001102(与BmorDnaJ(HSP40)homolog 9比对结果覆盖度达99%),其他6个HcunHSP40与家蚕不同的BmorDnaJ(HSP40)的NCBI-Blast比对结果中的覆盖度均达到了100%(见表1),相似度极高。研究表明HSP20保守性较差,所以8个HcunHSP20在NCBI中比对结果相对于其他HcunHSPs的同源比对结果中,覆盖度和相似度偏低,但仍具有一定的相似性。
图表编号 | XD00144556400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 杨广生、张兰、张猛、陈琪 |
绘制单位 | 露水河林业局病虫防治检疫站、长春市园林规划研究院、露水河林业局病虫防治检疫站、东北师范大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |