《表2 辣椒BES1基因家族成员鉴定》

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《辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析》


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利用BES1_N结构域的隐马尔可夫模型在辣椒基因组数据库PGP(http://peppergenome.snu.ac.kr/)进行BLAST比对,从CM334基因组中鉴定出9个BES1转录因子候选成员(表2)。9个候选基因与遵辣一号基因组进行比对,用遵辣一号基因对候选基因序列中有空位的进行修正。BES1基因家族开放阅读框大小介于546(CA10g04670)~2 142 bp(CA08g07160)之间,编码蛋白序列长度范围介于181(CA10g04670)~713个氨基酸(CA08g07160)之间,分子量介于20.22(CA10g04670)~78.23 kDa(CA08g07160)之间,等电点介于5.48(CA02g13270)~9.23(CA04g20150)之间。