《表1 剑麻ARF基因家族信息表》

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《基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析》

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通过对转录组数据库的本地Blast文库进行检索，共获得16条ARF序列，经CCD在线数据库分析后最终获得15个含有保守结构域的ARF序列。按照基因在转录组中的ID大小为剑麻ARF编号，即AhARF 1～AhARF15，见表1。从表中可以看出15个AhARF基因大小为1230～3036 bp，相应的编码氨基酸个数为409～1011个，编码蛋白质理论分子量大小为45.17～112.13 ku。编码蛋白质理论等电点大小为5.17～9.34，其中有5个大于7，平均大小为6.54，呈现弱酸性。不稳定指数均大于40，均为不稳定蛋白。平均亲水系数均小于零，说明各蛋白均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测分析表明AhARF1和AhARF4定位于叶绿体，其他AhARFs则均定位在细胞核。