《表1 玉米CCT基因家族信息》
经SMART与CDD数据库对ZmCCT23与ZmCCT43筛选与鉴定无法识别T001转录因子,所以选用T002转录因子
利用Pfam数据库搜索并下载CCT基因家族中的隐马氏模型文件,Pfam号码:PF06203,通过在线数据库SMART和CDD比对鉴定,除去冗余并检查缺失,获得含有CCT结构域的基因,最终获得57个玉米序列,分别命名为ZmCCT1~ZmCCT57(表1)。比较分析玉米57个CCT蛋白序列,结果显示不同的蛋白差异较大:氨基酸长度为181 aa (ZmCCT42)~641 aa (ZmCCT41),开放阅读框长度788 bp (ZmCCT17)~34099 bp (ZmCCT43),分子量为19.52 kD (ZmCCT42)~71.01 kD (ZmCCT41),等电点为4.43 (ZmCCT27)~12.00 (ZmCCT50),含有1 (ZmCCT18)~29 (ZmCCT47)个外显子。此外,有43个编码蛋白等电点都小于7,表明这些CCT基因可能编码弱酸性蛋白,可能会在酸性亚细胞环境中发挥作用。
图表编号 | XD0099426500 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.07.16 |
作者 | 郭栋、杜媚、周宝元、高卓晗、曹哲统、赵明 |
绘制单位 | 中国农业科学院作物科学研究所、东北农业大学农学院、河北北方学院农林科技学院、东北农业大学农学院、中国农业科学院作物科学研究所、东北农业大学农学院、北京化工大学生命科学与技术学院、中国农业科学院作物科学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |