《表1 马铃薯CBL基因家族成员信息》
通过生物信息学方法分析筛选的13个CBL基因,按照其在染色体上的位置和顺序进行命名,依次为StCBL1~StCBL13(表1)。这些基因的预测编码区长度在642~774 bp之间,无明显差异。进一步对其基因的序列结构分析,发现除StCBL1只含有一个外显子外,其余StCBLs基因均含有7~9个外显子(图1)。对StCBLs编码蛋白的理化性质进行统计,结果显示(表2),其氨基酸长度在213~257aa之间,分子量大多在24.32 kD到25.90 kD之间,只有StCBL10的分子量达到了29.88 kD,理论等电点pI=4.53~5.30,不稳定系数在28.91~51.72之间,亲水性平均指数(GRAVY)均为负值。预测这13个CBL蛋白均属于亲水性蛋白,且CBL2、CBL4、CBL6、CBL10、CBL12、CBL13为不稳定蛋白(不稳定系数>40),CBL1、CBL3、CBL5、CBL7、CBL8、CBL9、CBL11为稳定蛋白(不稳定系数<40)。
图表编号 | XD0050945700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.14 |
作者 | 蔡诚诚、王伟莉、张杰、邓孟胜、黄涛、余丽萍、李立芹、王西瑶 |
绘制单位 | 四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学作物科学国家级实验教学示范中心、四川农业大学农学院马铃薯研究与开发中心、四川农业大学作物科学国家级实验教学示范中心 |
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