《表1 大豆UBC基因家族信息》

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《大豆UBC基因家族鉴定及GmUBC46基因的功能初步分析》

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利用拟南芥UBC家族成员蛋白序列，通过blast比对鉴定出了41个大豆UBC基因家族成员。利用已鉴定出的41个大豆UBC家族成员泛素结合酶保守结构域（Ubiquitin-conjugating enzyme conserved domain），通过构建隐马尔可夫模型（HMM）及本地blast比对，获得了214个UBC基因家族成员。进一步通过PFAM及SMART在线数据库分析蛋白序列及泛素结合酶保守结构域，去掉152个重叠基因及8个不完整的泛素结合酶保守结构域基因，共鉴定出54个非冗余的大豆UBC基因家族成员。如表1所示，GmUBC基因家族成员CDS区分布在447～3387 bp之间，差异较大，同样，蛋白相对分子质量与理论等电点也分别有较大差异，如相对分子质量为16411.90～124205.20 Da，理论等电点为4.26～9.65。以上结果表明，GmUBC家族成员在基因编码序列及理化性质方面存在较大的差异。此外，除第14条染色体，GmUBC基因家族成员均匀地分布在大豆的染色体上。