《表1 小麦VQ基因家族信息》

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《小麦VQ家族全基因组鉴定与表达分析》

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小麦的全基因组序列和蛋白序列自Phytozome数据库下载。使用HMMER软件搜索小麦蛋白质组数据库，共获得39条转录本序列。经过HMMER和SMART搜索，最终鉴定了25个VQ基因。统计结果表明（表1），小麦中VQ基因编码的蛋白质最短为66 aa（Traes＿3AS＿22575A326.1），最长为420 aa（Traes＿5BL＿C205AA973.1），蛋白质序列长度变化较大。大多数小麦VQ蛋白较短，25个VQ蛋白中仅有两个序列大于300个氨基酸；小麦VQ蛋白分子量（molecular weight，MWs）在7.13 kD（Traes＿3AS＿22575A326.1）到42.8 kD（Traes＿5BL＿C205AA973.1）之间；等电点（Isoelectric point，pI）分布在5.08（Traes＿4BL＿E4F2-9BBBC.1）到12.01（Traes＿3AS＿22575A326.1）之间，大多数VQ蛋白均为中性或偏碱性蛋白，其中仅有5个VQ蛋白偏酸性，等电点小于7.0。对基因的外显子-内含子结构组成进行分析，发现仅有一个VQ基因（Traes＿3B＿A958F1F75.1）含有1个内含子，其余基因均为单外显子基因。