《表1 CsERF基因家族相关信息》
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《黄瓜ERF基因家族鉴定及其在雌花芽分化中的表达分析》
*:有信号肽;#:有跨膜结构域*:Signal peptide;#:Transmembrane domain
通过双向BLAST分析,以拟南芥AP2/EREBP基因家族为参考,对黄瓜基因组中ERF基因家族进行鉴定,共鉴定出138个具有AP2/ERF结构域的基因(图1),根据其在9930_V2基因组中的ID,分别命名为CsERF1—CsERF138。长度介于126—745个氨基酸。通过BLAST比对,将9930_V2基因组ERF家族成员比对到拟南芥TAIR10基因组中,获取对应基因名称(表1)。相比根据9930_V1版本所鉴定的103个ERF基因[13],本研究新鉴定出25个ERF家族成员,并将全部138个ERF定位于染色体。
图表编号 | XD00143859100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 潘健、温海帆、何欢乐、连红莉、王刚、潘俊松、蔡润 |
绘制单位 | 上海交通大学农业与生物学院、上海交通大学农业与生物学院、上海交通大学农业与生物学院、上海交通大学农业与生物学院、上海交通大学农业与生物学院、上海交通大学农业与生物学院、上海交通大学农业与生物学院 |
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