《表1 芝麻赤霉素合成相关基因家族信息》

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《芝麻赤霉素合成相关基因鉴定与表达分析》


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以拟南芥GA合成基因为参考序列,利用BLASTP方法在芝麻基因组中共鉴定出32个GA合成相关基因(表1),分属7个基因家族。其中CPS家族基因5个、KS家族基因3个、KAO家族基因2个、KO家族基因3个、GA20ox家族基因7个、GA2ox家族基因9个、GA3ox家族基因3个。在这些基因中,CPS、KO家族主要集中在芝麻6号和3号染色体上,表现出一定的分布偏向性,而其他基因家族的分布没有明显的特征,除5号染色体外,各个染色体上均有GA合成基因分布。与水稻、大豆、葡萄、高粱、番茄等物种相比,芝麻中赤霉素合成相关基因数目处于中等水平,但在CPS家族中,芝麻的基因数目明显多于其他物种(表2)。