《表2 默诺霉素合成基因比较分析》

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《基因组挖掘默诺霉素生物合成基因簇的比较分析》

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注:-:基因簇中无同源基因

通过NCBI Blastp工具以S.ghanaensis基因组中的Moe合成基因为参照，与另外5株菌中的Moe合成基因比对，结果以其蛋白质中氨基酸序列相似度及覆盖度进行展示（表2）。S.ghanaensis与S.bambergiensis和S.prasinus的单基因Blastp比较发现：（1）基因的覆盖度和相似度均高于80%，然而如此高的单基因同源性，在S.bambergiensis，S.prasinus中却未找到由moeA5、B5、C5组成的moe cluster 2，结合图2的进化水平分析，S.ghanaensis与两株葱绿链霉菌的moe cluster 1处于不同的进化水平；（2）S.lincolnensis和S.sp.SAT1与S.ghanaensis相比具有较高的序列覆盖度，几乎所有序列在90%以上；但相似度较低，除了moeK5，moeX5，moeM5转运相关合成基因>80%外，其余合成基因相似度仅在66%～76%之间。基于在染色体两臂区位置和基因在染色体上的反向排列的情况，说明S.lincolnensis和S.sp.SAT1与S.ghanaensis、S.bambergiensis、S.prasinus的moe cluster 1具有不同来源，以此推测本研究研究的moe cluster 1存在两种进化类型。