《表2 葡萄Trihelix基因家族信息及理化性质》

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《葡萄Trihelix转录因子家族生物信息及其基因表达分析》


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利用拟南芥和水稻基因,经葡萄基因组网同源搜索,总共得到27个葡萄Trihelix基因,对克隆出的葡萄Trihelix家族基因分别命名为VvTrihelix1~VvTrihelix27。由表2分析可知,葡萄Trihelix转录因子家族氨基酸残基为175~880个,VvTrihelix9序列最长,含880个氨基酸残基,VvTrihelix19最短,只含有175个氨基酸残基;相对分子量集中在19 728.04~98 002.1 bp;等电点pI位于4.71~9.62之间;以VvTrihelix3的稳定性最低,为23.35,VvTrihelix2稳定性最高,为65.57;脂肪指数介于49.78~101.72之间;该转录因子家族大多具有疏水性,只有VvTrihelix7具有亲水性(表2)。该转录因子家族主要分布于01、02、04、08、09、10、12、13、14、17、18号染色体上,其中14和17号染色体分布最多,均含有5个;VvTrihelix5、VvTrihelix6和VvTrihelix21基因分布未知(图1)。