《表4 近无柄雅榕叶绿体基因组中SSR不同重复单元的出现频数》

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《浙江近无柄雅榕古树叶绿体基因组特征分析》


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微卫星(Simple Sequence Repeats,SSR)标记具有标记数量丰富、共显性遗传、重复性好等特点,被广泛用于构建遗传图谱、分析亲缘关系和种群结构等[12-16]。本研究从近无柄雅榕叶绿体基因组中检索到68个SSR,其中包括11个复合型SSR、52个单碱基重复、4个二碱基重复和1个三碱基重复,出现次数最多的SSR是单碱基重复,约占76.47%;叶绿体基因组中平均每2.36 kb有一个SSR位点(见表3)。检索到的SSR中共有4种重复单元类型,其中2种为单碱基重复,分别为A/T和C/G,绝大多数为A/T类型,占98.61%;二碱基重复和三碱基重复各有1种,主要重复单元类型分别为AT/TA和TTA/AAT(见表4)。