《表2 灵宝杜鹃基因组中SSR位点信息》

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《基于RAD-seq技术开发灵宝杜鹃多态性SSR标记》

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运用MISA软件（http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa），共在简化基因组DNA序列中检测到6 107个SSR位点，其中复合型（compound）较少，仅有497个，占位点总数的8.14%；完全重复型（perfect）有5 610个，占位点总数的91.86%，具体信息如表2所示。其中，二核苷酸类型所占比例最高，数量为3 848，占位点总数的63.01%；其次是三核苷酸，有765个，占位点总数的12.53%，单核苷酸有463个，占SSR位点总数的7.58%，四核苷酸和五核苷酸分别有283和170个，比例各为4.63%和2.78%，最少的是六核苷酸，只有81个。另外，在完全重复型SSR位点中，六核苷酸类型重复序列的平均长度最长，可达26.82 bp，单核苷酸类型的平均长度最短，为16.40 bp。